中医药信息资源合作中心是在所长、主管副所长的领导下，组织开展中医药信息科研项目、负责对外交流与合作、实现科研成果转化与推广等工作的部门，其主要职责如下：

1．开展中医药信息科研课题的申报与实施，开展对外的科研合作与交流；

2．整合信息所信息资源，提高中医药信息利用率，扩大信息所资源及产品在国内外的影响力；

3．促进信息所科研成果的转化与推广；

4．开展中医药信息资源的网络推广与服务；